除 定 期 刊 物 外， 博 物 館 的 圖 書 館 擁 有 大 約 2500 本 書 藉。 除 一 般 閱 讀 書 籍 外， 亦 可 找 到 一 些 富 代 表 性 的 專 題 書 籍， 如 海 事 技 術 學、 海 事 民 俗 學、 葡 萄 牙 及 中 國 海 事 歷 史、 大 發 現 的 歷 史、 澳 門 歷 史、 船 隻 的 建 造、 模 型 製 造、 水 族 學 和 軟 體 動 物 學 等 等。 公 眾 亦 可 使 用 本 圖 書 館 (需 預 先 得 到 批 准)， 但 只 可 在 館 內 閱 讀 及 須 遵 守 本 圖 書 館 的 規 則。

博 物 館 的 相 片 檔 案 庫 擁 有 相 當 數 量 的 圖 片， 當 中 記 載 了 有 關 船 隻 的 資 料， 和 澳 門 近 代 發 生 的 事 件。 其 中 包 括 有 由 1920 年 至 近 期 的 底 片。 研 究 人 員 和 讀 者 在 此 可 找 到 有 關 各 方 面 主 題 的 重 要 資 料， 尤 其 是 海 事 方 面。 在 圖 則 和 計 劃 檔 案 庫 可 找 到 一 些 古 老 的 葡 萄 牙 大 型 船 隻 的 圖 則， 如 戰 艦、 商 船、 漁 船 等 等。

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